广西狂犬病野毒株L基因3_端的多态性分析

第31卷第11期2009年11月

中国预防兽医学报

ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicine

Vol.31,No.11Nov.2009

广西狂犬病野毒株L基因3'端的多态性分析

兰,陆

武,王

雯,李

回,梁晶晶,孟先明,潘

艳,唐黄惠,罗廷荣

*

(广西大学动物科学技术学院,广西南宁530004)

摘要:为了解狂犬病病毒(RV)的变异情况,本研究对广西不同地区的22个RV分离株的L基因3'端片段

进行克隆和测序,与国内外发表的RV街毒、固定毒株及类RV株相应部分的多态性进行了比较分析。结果表明,所测定的22个广西RV野毒分离株属于基因Ⅰ型,可分为3个群即Ⅰ群、Ⅱ群和Ⅲ群。其中13株属于Ⅰ群,其核苷酸同源性为96.9%~100.0%,氨基酸同源性为98.2%~100.0%;8株属于Ⅱ群,株核苷酸同源性为96.5%~99.7%,氨基酸同源性为97.8%~100.0%。仅1株属于Ⅲ群。22个RV分离株与RV固定毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为79.5%~86.9%和85.8%~96.5%,与类RV核苷酸和氨基酸的同源性分别为65.7%~70.3%和70.4%~76.5%。

关键词:狂犬病病毒;L基因3'端;多态性分析中图分类号:D852.65

文献标识码:A

文章编号:1008-0589(2009)11-0906-04

PolymorphismanalysisofLgene3'terminalof

rabiesvirusisolatedfromGuangxiprovince

ZENGLan,LUWu,WANGWen,LIHui,LIANGJing-jing,MENGXian-ming,PANYan,TANGHuang-hui,LUOTing-rong*

(CollegeofAnimalScienceandTechnology,GuangxiUniversity,Nanning530004,China)

Abstract:InthisstudythecDNAsequencesofLgene3'terminaloftwenty-tworabiesvirus(RV)isolatesfromdifferentregionsofGuangxiprovincewereclonedandsequenced.ThenucleotidesequencesanddeducedaminoacidsequencesoftheLgene3'terminalregionoftheseisolateswerecomparedwiththatoffixedvirusstrainsandrabies-relatedvirusstrainspublishedpreviously.TheresultsindicatedallRVisolatesfromGuangxiweregenotypeIofLyssavirusandcouldbedividedintothreegroupsasⅠ,ⅡandⅢ.Ofwhich,thirteenisolateswereclassifiedtogroupIwithaidentityof96.9%to100%atnucleotidelevel(NL)and98.2%to100%ataminoacidlevel(AAL);EightisolatesbelongedtogroupⅡwith96.5%to99.7%atNLand97.8%to100%atAAL;OnlyoneisolatebelongedtogroupⅢ.ComparingtheisolateswiththefixedRVstrains,theidentitywere79.5%to86.9%atNLand85.8%to96.5%atAAL,respectively,andthehomologieswere65.7%to70.3%atNLand70.4%to76.5%atAAL,respectively,comparedwithrabies-relatedvirusstrains.

Keywords:rabiesvirus;Lgene3'terminal;polymorphismanalysis

狂犬病为全世界性分布[1-10]。狂犬病病毒(Rabiesvirus,RV)属于弹状病毒科(Rhabdoviridae)狂犬病毒属(Lyssavirus),含有一条负链单股RNA。其RNA

*Correspondingauthor

被核蛋白紧密包裹,形成RNP复合物,只有RNP复合物可以被聚合酶识别作为转录和复制的模板,转录和复制过程由RNA聚合酶催化。RNP复合物

收稿日期:2008-12-20

基金项目:广西科学研究与技术开发计划项目(桂科攻0537008-3C);广西科学基金项目(桂科自0249007);

教育部留学回国人员科研启动基金(教外司留[1998]679号)

作者简介:曾兰(1980-),女,广西北流人,硕士研究生,研究方向为动物传染病学与分子生物学.*通信作者:E-mail:tingrongluo@http://www.wendangwang.com;trluo@http://www.wendangwang.com

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